大化改新に中大兄皇子側について、同族の蘇我氏を滅ぼした蘇我倉山田石川麻呂（そがのくらのやまだのいしかわまろ）の発願により641年（舒明天皇13年）に建て始めたとされている寺です。石川麻呂は、入鹿殺害のクーデタに加わりその後、右大臣に任ぜられましたが、649年（大化5）、反乱の疑いをかけられて、この寺で自害しました。しかし、その後、疑いは晴れ、皇室の援助で寺の造営は続けられ685年に完成しました。しかし中世以降は衰微し、明治時代初期の廃仏毀釈の際に廃寺となりましたが、明治25年（1892年）に小寺院として再興されています。